Hallo Moritz,
um einem Lieferanten sowohl Rechnungen als auch Verbindlichkeiten zu zuordnen, benötigt er die Rollen Kunde und Lieferant.
Diese vergibst du direkt unter: Stammdaten->Adressen->Rollen wie gewohnt.
Mehr unter: Adressen
Die Rechnungen und die Verbindlichkeiten erhalten eine Nummer aus dem Nummernkreis und können daraufhin im Zahlungseingang zugeordnet werden. Eine direkte Verrechnung ist hier jedoch nicht möglich.
Du kannst aber Gutschriften mit Rechnungen verknüpfen und somit verrechnen. Mach dich einmal schlau zum Thema Gutschriftverfahren und sprich ggf. hierzu einmal mit deinem Steuerberater, ob dies für dich Nachteile hat.
Konkret würde das bedeuten, dass dein Lieferant keine Rechnung mehr schreibt, sondern du beides machst Rechnungen und Gutschriften oder halt umgekehrt.
Diese Gutschriften könntest du dann mit der Rechnung verknüpfen und im Saldo würde dies berücksichtigt werden.